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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
12/11/2015 |
Actualizado : |
28/10/2019 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
BENÍTEZ-GALEANO, M.J.; RUBIO, L.; BERTALMIO, A.; MAESO, D.; RIVAS, F.; COLINA, R. |
Afiliación : |
MARÍA JOSÉ BENÍTEZ-GALEANO, Universidad de la República (UdelaR)/ Centro Universitario Regional Noroeste, Salto (CENUR); LETICIA PAOLA RUBIO CATTANI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; ANA MARIA BERTALMIO CASARIEGO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; DIEGO CESAR MAESO TOZZI, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; CARLOS FERNANDO RIVAS GRELA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; RODNEY COLINA, Universidad de la República (UdelaR)/ Centro Universitario Regional Noroeste, Salto (CENUR). |
Título : |
Phylogenetic studies of the three RNA silencing suppressor genes of south american ctv isolates reveal the circulation of a novel genetic lineage. |
Fecha de publicación : |
2015 |
Fuente / Imprenta : |
Viruses, 2015, v.7, no.7, p.4152-4168. OPEN ACCESS. |
ISSN : |
1999-4915 |
DOI : |
10.3390/v7072814 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Received: 26 May 2015 / Accepted: 17 July 2015 / Published: 22 July 2015. |
Contenido : |
ABSTRACT.
Citrus Tristeza Virus (CTV) is the most economically important virus of citrus worldwide. Genetic diversity and population structure of CTV isolates from all citrus growing areas from Uruguay were analyzed by RT-PCR and cloning of the three RNA silencing suppressor genes (p25, p20 and p23). Bayesian phylogenetic analysis revealed the circulation of three known genotypes (VT, T3, T36) in the country, and the presence of a new genetic lineage composed by isolates from around the world, mainly from South America. Nucleotide and amino acid identity values for this new genetic lineage were both higher than 97% for the three analyzed regions. Due to incongruent phylogenetic relationships, recombination analysis was performed using Genetic Algorithms for Recombination Detection (GARD) and SimPlot software. Recombination events between previously described CTV isolates were detected. High intra-sample variation was found, confirming the co-existence of different genotypes into the same plant. This is the first report describing: (1) the genetic diversity of Uruguayan CTV isolates circulating in the country and (2) the circulation of a novel CTV genetic lineage, highly present in the South American region. This information may provide assistance to develop an effective cross-protection program. |
Palabras claves : |
CITRUS TRISTEZA VIRUS; RT-PCR. |
Thesagro : |
CITRUS; CRUZAMIENTO INTERCROMOSOMICO; FILOGENIA; RECOMBINACION; URUGUAY. |
Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/5167/1/Rivas-F.-Maeso-D.-2015.-Viruses.pdf
http://www.mdpi.com/1999-4915/7/7/2814
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Marc : |
LEADER 02270nam a2200289 a 4500 001 1053851 005 2019-10-28 008 2015 bl uuuu u0uu1 u #d 022 $a1999-4915 024 7 $a10.3390/v7072814$2DOI 100 1 $aBENÍTEZ-GALEANO, M.J. 245 $aPhylogenetic studies of the three RNA silencing suppressor genes of south american ctv isolates reveal the circulation of a novel genetic lineage.$h[electronic resource] 260 $aViruses, 2015, v.7, no.7, p.4152-4168. OPEN ACCESS.$c4168 500 $aArticle history: Received: 26 May 2015 / Accepted: 17 July 2015 / Published: 22 July 2015. 520 $aABSTRACT. Citrus Tristeza Virus (CTV) is the most economically important virus of citrus worldwide. Genetic diversity and population structure of CTV isolates from all citrus growing areas from Uruguay were analyzed by RT-PCR and cloning of the three RNA silencing suppressor genes (p25, p20 and p23). Bayesian phylogenetic analysis revealed the circulation of three known genotypes (VT, T3, T36) in the country, and the presence of a new genetic lineage composed by isolates from around the world, mainly from South America. Nucleotide and amino acid identity values for this new genetic lineage were both higher than 97% for the three analyzed regions. Due to incongruent phylogenetic relationships, recombination analysis was performed using Genetic Algorithms for Recombination Detection (GARD) and SimPlot software. Recombination events between previously described CTV isolates were detected. High intra-sample variation was found, confirming the co-existence of different genotypes into the same plant. This is the first report describing: (1) the genetic diversity of Uruguayan CTV isolates circulating in the country and (2) the circulation of a novel CTV genetic lineage, highly present in the South American region. This information may provide assistance to develop an effective cross-protection program. 650 $aCITRUS 650 $aCRUZAMIENTO INTERCROMOSOMICO 650 $aFILOGENIA 650 $aRECOMBINACION 650 $aURUGUAY 653 $aCITRUS TRISTEZA VIRUS 653 $aRT-PCR 700 1 $aRUBIO, L. 700 1 $aBERTALMIO, A. 700 1 $aMAESO, D. 700 1 $aRIVAS, F. 700 1 $aCOLINA, R.
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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Tipo / Formato
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Cutter
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Volumen
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Estado
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA La Estanzuela. |
Fecha actual : |
24/03/2017 |
Actualizado : |
31/03/2017 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Agropecuarias |
Autor : |
FASSIO, A.; PÉREZ, O.; IBAÑEZ, W.; CERETTA, S.; RABAZA, C.; VERGARA, G. |
Afiliación : |
ALBERTO SANTIAGO FASSIO ARAUJO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; OSVALDO MARTIN PEREZ GONZALEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; WILFREDO ARIEL IBAÑEZ ALVEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SERGIO EDUARDO CERETTA SORIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; CARLOS MARIANO RABAZA LOPEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; GLENDA ALEJANDRA VERGARA GARCIA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
Título : |
Soja: adaptación de ciclos de madurez a diferentes épocas de siembra bajo condiciones de riego. |
Fecha de publicación : |
2017 |
Fuente / Imprenta : |
Revista INIA Uruguay, 2017, no.48, p. 28-33. |
Serie : |
(Revista INIA; 48) |
ISSN : |
1510-9011 |
Idioma : |
Español |
Contenido : |
El objetivo del trabajo fue estudiar cómo los requerimientos foto-térmicos de dos ciclos de madurez, corto
y largo, inciden en diferentes épocas de siembra.Se realizaron cuatro experimentos en condiciones de
campo en la estación experimental INIA La Estanzuela (Uruguay), todos bajo régimen de riego con el objetivo
de neutralizar el efecto más importante y no manejable que incide en los cultivos de verano: el agua disponible
para el cultivo. Los experimentos se sembraron en cuatro fechas de siembra: 21 de octubre, 7 de noviembre,
28 de noviembre y 15 de diciembre de 2014. El diseño experimental para cada experimento fue de bloques al
azar con seis repeticiones y cuatro cultivares, dos definidos como de ciclo corto para Uruguay (GM III y IV) y
dos definidos como de ciclo largo (ambos de GM VII). La siembra de los cultivares, tolerantes al herbicida glifosato
y de amplio uso comercial, se realizó a 0,20 m de distancia entre hileras y entre plantas. Considerando
el nivel de fósforo inicial disponible, los experimentos se fertilizaron con una cantidad de fósforo que excediera
el umbral de respuesta. La semilla fue inoculada de acuerdo a lo recomendado por el fabricante. Se realizaron
aplicaciones químicas de rutina para el control de malezas e insectos. Los riegos se realizaron periódicamente
antes de que el porcentaje de agua disponible llegara a 50 % del perfil. Previo a la cosecha se
determinó fecha de emergencia (VE); de primera flor (R1); comienzo de llenado de grano (R5) y madurez
fisiológica plena (R8), según Fehr y Caviness (1977). Luego de la cosecha se determinó el rendimiento de
grano corregido a 13 % de humedad. MenosEl objetivo del trabajo fue estudiar cómo los requerimientos foto-térmicos de dos ciclos de madurez, corto
y largo, inciden en diferentes épocas de siembra.Se realizaron cuatro experimentos en condiciones de
campo en la estación experimental INIA La Estanzuela (Uruguay), todos bajo régimen de riego con el objetivo
de neutralizar el efecto más importante y no manejable que incide en los cultivos de verano: el agua disponible
para el cultivo. Los experimentos se sembraron en cuatro fechas de siembra: 21 de octubre, 7 de noviembre,
28 de noviembre y 15 de diciembre de 2014. El diseño experimental para cada experimento fue de bloques al
azar con seis repeticiones y cuatro cultivares, dos definidos como de ciclo corto para Uruguay (GM III y IV) y
dos definidos como de ciclo largo (ambos de GM VII). La siembra de los cultivares, tolerantes al herbicida glifosato
y de amplio uso comercial, se realizó a 0,20 m de distancia entre hileras y entre plantas. Considerando
el nivel de fósforo inicial disponible, los experimentos se fertilizaron con una cantidad de fósforo que excediera
el umbral de respuesta. La semilla fue inoculada de acuerdo a lo recomendado por el fabricante. Se realizaron
aplicaciones químicas de rutina para el control de malezas e insectos. Los riegos se realizaron periódicamente
antes de que el porcentaje de agua disponible llegara a 50 % del perfil. Previo a la cosecha se
determinó fecha de emergencia (VE); de primera flor (R1); comienzo de llenado de grano (R5) y ... Presentar Todo |
Palabras claves : |
DISPONIBILIDAD DEL AGUA; FOTOPERÍODO; LONGITUD DEL DIA. |
Thesagro : |
CULTIVOS; GLICINE MAX; SOJA; TEMPERATURA DEL AIRE; TEMPERATURA DEL SUELO. |
Asunto categoría : |
-- |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/6626/1/revista-INIA-48-marzo-2017.p.28-33-Fassio-et-al..pdf
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Marc : |
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Registro original : |
INIA La Estanzuela (LE) |
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